106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  355  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  59.76 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.14 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.29 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.65 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  57.56 
 
 		 173 aa  170  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.53 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.53 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.53 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  59.42 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.34 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.77 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.58 
 
 		 184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.62 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.74 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.12 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.31 
 
 		 231 aa  141  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.42 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.78 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.89 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  44.25 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.79 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  42.95 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  38.81 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.18 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  35.2 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.67 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  30.21 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  37.66 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.6 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.07 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  27.62 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  31.33 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  29.17 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  29.17 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  33.77 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  28.3 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  31.51 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01130  hypothetical protein  36.56 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  27.08 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  31.33 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  29.73 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  30.12 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.79 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  27.08 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  27.08 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  28.43 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  27 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  27.08 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  27.08 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  24.71 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  26.04 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.87 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  27.27 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.7 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1027  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.87 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.278653  normal  0.0205015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  30.11 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  34.18 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  26.67 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.37 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  27.71 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0686  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.68 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  24.11 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002487  hypothetical protein  30.34 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190269  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  38.18 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.99 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  22.41 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1123  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.19 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.435066 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  23.66 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  22.86 
 
 		 163 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  36.92 
 
 		 158 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2645  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00567301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>