63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4145 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 173 aa  341  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  71.26 
 
 		 171 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  71.26 
 
 		 173 aa  218  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  73.65 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.93 
 
 		 172 aa  210  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  64.67 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.86 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.95 
 
 		 184 aa  190  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.36 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.73 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  64.61 
 
 		 231 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.38 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.14 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.14 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  57.14 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.53 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.39 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.91 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.57 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.81 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  49.72 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.07 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  40.12 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.12 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  43.95 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.3 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  38 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  34.65 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  35.62 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  35.23 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.42 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  32.22 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.1 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  30.95 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.75 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  30.36 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  30.36 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  41.38 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  31.58 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.11 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  32.91 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  27.16 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  27.56 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  30.77 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  32.5 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.21 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  34.55 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  31.67 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  32.73 
 
 		 164 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3088  YbaK/EbsC protein  24.79 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  24.36 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.29 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630497  hitchhiker  0.00199357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  29.17 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  26 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  32.88 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  26.58 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3220  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.95 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000408202  normal  0.0156716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>