38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1840 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 182 aa  356  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  65.54 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  62.64 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.36 
 
 		 173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.58 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.76 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.37 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.65 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.08 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  61.88 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.73 
 
 		 184 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.55 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.55 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  59.65 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.73 
 
 		 177 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.49 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.73 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.03 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.87 
 
 		 186 aa  150  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  49.11 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.14 
 
 		 190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.59 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  42.77 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.85 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  45.26 
 
 		 180 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.48 
 
 		 127 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  33.82 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.71 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.61 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.86 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  27.83 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  26 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  28.17 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5579  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.07 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1416  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.45 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  40.38 
 
 		 168 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  29.32 
 
 		 159 aa  40.8  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>