184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1813 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1813  transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  343  5e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1963  hypothetical protein  57.76 
 
 
161 aa  190  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0670259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  52.41 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  54.22 
 
 
158 aa  169  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  50.6 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  50.32 
 
 
168 aa  149  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0854  hypothetical protein  46.2 
 
 
170 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000580569  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  42.34 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  30.99 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
157 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  37.06 
 
 
161 aa  91.3  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  34.12 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  35.92 
 
 
162 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  37.42 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  32.08 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  28.14 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  34.78 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  31.41 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  28.74 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.91 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  32.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  29.27 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  31.25 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  30.43 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  26.95 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  29.75 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  35.04 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  35.04 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  34.21 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  30.19 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  30.19 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  32.61 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  28.75 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  28.39 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  29.56 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  28.93 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  29.56 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  28.93 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.74 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  34.15 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.21 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  32.48 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  28.93 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  26.79 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  28.3 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  31.85 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  31.45 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0955  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0993  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.206645  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  32 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  30.86 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0957  ybaK/ebsC protein  28.93 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  29.49 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  30.25 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  30.57 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  30.57 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  29.38 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  27.61 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  33.04 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  28.3 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  31.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  31.36 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  28.21 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1124  hypothetical protein  28.3 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.47 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  29.82 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  32.46 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  30.7 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  30.89 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2761  hypothetical protein  25.47 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  30.7 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  30.7 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  27.42 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  28.99 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  30.7 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  35.48 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  31.03 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  27.22 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  31.03 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  26.45 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>