241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1347 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1347  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.949799  hitchhiker  0.00364047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  76.47 
 
 
155 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  73.42 
 
 
159 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1048  hypothetical protein  65.03 
 
 
168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  61.78 
 
 
171 aa  186  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.52 
 
 
157 aa  184  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.87 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1407  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.12 
 
 
167 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3470  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.03 
 
 
162 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.116245  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.65 
 
 
201 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1624  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.86 
 
 
153 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0992  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.48 
 
 
163 aa  163  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.07 
 
 
162 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3926  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.65 
 
 
163 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0764  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60.39 
 
 
155 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0345429  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1868  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.9 
 
 
158 aa  145  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2115  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.56 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.74 
 
 
163 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0312  ybaK/ebsC protein  47.77 
 
 
168 aa  123  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.12 
 
 
164 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.5 
 
 
164 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4271  hypothetical protein  46.98 
 
 
173 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0439  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.64 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2871  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.806354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2956  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.22 
 
 
186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3008  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0335  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.45 
 
 
179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.48 
 
 
177 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2981  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.22 
 
 
168 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2346  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.22 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2960  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.22 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333843  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6310  YbaK/prolyl-tRNA synthetase like protein  43.95 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.97 
 
 
161 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2103  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.41 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0542  YbaK  46.5 
 
 
168 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0351  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  46.5 
 
 
168 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0365  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  46.5 
 
 
168 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.24 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.16 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  44.3 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.95 
 
 
166 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.28 
 
 
166 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0132  hypothetical protein  44.37 
 
 
163 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  41.77 
 
 
248 aa  104  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1918  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.18 
 
 
158 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0942433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.46 
 
 
165 aa  103  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  43.62 
 
 
165 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.22 
 
 
157 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.4 
 
 
167 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.28 
 
 
162 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  39.19 
 
 
156 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.03 
 
 
162 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.03 
 
 
162 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.31 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.25 
 
 
250 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1128  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.62 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.25 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.41 
 
 
251 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.08 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.48 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.79 
 
 
221 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.75 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1085  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.31 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549575  normal  0.623035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2447  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  38.51 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.106663  hitchhiker  0.000551583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.88 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2512  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.73 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.06 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.11 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.62 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3220  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.71 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000408202  normal  0.0156716 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.28 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2642  hypothetical protein  36.91 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0248057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1299  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.91 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1077  ybaK/ebsC protein  36.52 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.3293  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.77 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  30 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3773  ybaK/ebsC protein  34.78 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1593  hypothetical protein  37.21 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  41.1 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  32.99 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  40 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  31.47 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  41.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  32.99 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  39.73 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  28.1 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.35 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3616  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  30.58 
 
 
160 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2809  ybaK/ebsC protein  27.83 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2696  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  36.84 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.57 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>