201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1299 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1299  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2642  hypothetical protein  98.71 
 
 
156 aa  299  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0248057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1085  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.23 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549575  normal  0.623035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2447  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  60.65 
 
 
166 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.106663  hitchhiker  0.000551583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2512  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  67.31 
 
 
156 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1128  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.56 
 
 
171 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.71 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.71 
 
 
164 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.71 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.37 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0132  hypothetical protein  40.27 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.37 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 
162 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2103  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.07 
 
 
162 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  41.56 
 
 
170 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.62 
 
 
248 aa  103  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.06 
 
 
167 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.74 
 
 
174 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.96 
 
 
166 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  42.66 
 
 
165 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.61 
 
 
166 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.69 
 
 
165 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.31 
 
 
162 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.31 
 
 
162 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6310  YbaK/prolyl-tRNA synthetase like protein  40.52 
 
 
178 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.68 
 
 
156 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0312  ybaK/ebsC protein  41.61 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.41 
 
 
250 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.68 
 
 
157 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4271  hypothetical protein  40.27 
 
 
173 aa  97.1  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.75 
 
 
177 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.68 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.03 
 
 
221 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3008  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2871  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.806354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0439  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.93 
 
 
173 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2346  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2960  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333843  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2956  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.56 
 
 
186 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2981  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.75 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.61 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.35 
 
 
251 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.38 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.6 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0335  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.95 
 
 
179 aa  90.5  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0542  YbaK  41.06 
 
 
168 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.53 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0351  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  41.06 
 
 
168 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0365  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  41.06 
 
 
168 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1918  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.88 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0942433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.39 
 
 
158 aa  87  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0992  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.21 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3926  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.92 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.41 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.45 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0764  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.67 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0345429  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.66 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.31 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1048  hypothetical protein  37.58 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.55 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3470  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.29 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.116245  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  35.17 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1347  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.91 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.949799  hitchhiker  0.00364047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1624  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.46 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.94 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.13 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1868  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.88 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1407  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.67 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.69 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.81 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1123  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.73 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.435066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2912  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.56 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14862  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.82 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1237  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.56 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3616  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.29 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0561  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.155042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3220  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000408202  normal  0.0156716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.97 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2115  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.19 
 
 
160 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3822  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.19 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.808721  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6129  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.46 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.684201  normal  0.245919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  26.61 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.01 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.361078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  26.19 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  25.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  25.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  25.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  25.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  25.76 
 
 
159 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  29.91 
 
 
159 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  29.25 
 
 
159 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3997  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.61 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  28.97 
 
 
159 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>