More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0992 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0992  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 
163 aa  316  9e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3021  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.24 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00107771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1347  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.48 
 
 
158 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.949799  hitchhiker  0.00364047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3288  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.21 
 
 
171 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.545646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1048  hypothetical protein  56.36 
 
 
168 aa  153  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3470  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  59.44 
 
 
162 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.116245  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.13 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5549  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  54.42 
 
 
159 aa  148  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3243  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.74 
 
 
162 aa  147  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156466  normal  0.0643244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1407  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.9 
 
 
167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3551  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  57.36 
 
 
201 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146665  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3080  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.72 
 
 
157 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0335  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.37 
 
 
179 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2267  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.68 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6310  YbaK/prolyl-tRNA synthetase like protein  51.25 
 
 
178 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2956  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.88 
 
 
186 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1948  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.86 
 
 
164 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3926  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  58.28 
 
 
163 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0113  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.8 
 
 
166 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4271  hypothetical protein  50.31 
 
 
173 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1624  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.17 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2871  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.94 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.806354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0439  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.69 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3008  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.94 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.92 
 
 
167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0312  ybaK/ebsC protein  50 
 
 
168 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2981  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.31 
 
 
168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0260  hypothetical protein  47.47 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393792  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2346  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.31 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2960  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.31 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4709  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.03 
 
 
162 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0164  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.35 
 
 
177 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0899  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  51.97 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.322941  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0764  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  55.24 
 
 
155 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0345429  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.17 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.03 
 
 
162 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.784305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.03 
 
 
162 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445295  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  49.68 
 
 
248 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0119  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.86 
 
 
165 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0263477  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5963  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.68 
 
 
167 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851834  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0466  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.68 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.59 
 
 
174 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0132  hypothetical protein  44.37 
 
 
163 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  48.34 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1868  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.45 
 
 
158 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0351  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  50.63 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0542  YbaK  50.63 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0365  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  50.63 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0515  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.68 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0151737  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2115  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  44.97 
 
 
160 aa  117  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3353  hypothetical protein  46.75 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1128  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.85 
 
 
171 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2103  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.01 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0548  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.57 
 
 
163 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.39 
 
 
221 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0327  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.7 
 
 
160 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4036  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.4 
 
 
157 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2044  YbaK/EbsC family protein  36.84 
 
 
156 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.6 
 
 
157 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2174  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.84 
 
 
157 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000343666 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2447  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  40.26 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.106663  hitchhiker  0.000551583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1085  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.6 
 
 
156 aa  94  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549575  normal  0.623035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1918  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.55 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0942433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2642  hypothetical protein  42.21 
 
 
156 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0248057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1299  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.21 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2512  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.51 
 
 
156 aa  84  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0441  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.92 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3220  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.5 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000408202  normal  0.0156716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1212  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.26 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0760914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3482  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.61 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.45 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0821  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.88 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.811085  hitchhiker  0.0000000171458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  36.59 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4290  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.37 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000309077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.4 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  35.71 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  32.81 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0752  hypothetical protein  36.63 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0525  ybaK/ebsC protein  38 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.661143  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  33.87 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.01 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3961  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.43 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  33.33 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  33.88 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0535  hypothetical protein  29.29 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2476  ybaK/ebsC protein  31.09 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0283203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2605  ybaK/ebsC protein  32.32 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  33.58 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0203  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.53 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2557  ybaK/ebsC protein  31.09 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0739  ybaK/ebsC protein  31.09 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  29.03 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  33.04 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  33.06 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  32.26 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0728  ybaK/ebsC protein  32.32 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>