83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4731 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4731  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 167 aa  344  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4739  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  68.75 
 
 		 159 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0256  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.88 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2911  hypothetical protein  46.45 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2808  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.45 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3157  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.45 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.62 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0707  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5493  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.31 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.317787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3187  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.65 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1121  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.94 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0089  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.58 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1641  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.94 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0015255  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1640  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.94 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.850648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1849  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.69 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1541  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.29 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.699288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.65 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5009  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  41.94 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483603  normal  0.195058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1361  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.62 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153741  hitchhiker  0.000577706 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0018  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0394  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1535  YbaK  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101769  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1448  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1037  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.102528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1189  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2992  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.42 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0038  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  43.23 
 
 		 210 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1369  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated domain-containing protein  41.94 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.388098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0677  YbaK-like protein  39.74 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1260  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.88 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6360  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.65 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.31 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1733  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.65 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  40.65 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1354  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.9 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154586  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3384  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  36.13 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5904  hypothetical protein  38.06 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.515734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4653  YbaK/prolyl-tRNA synthetase domain-containing protein  31.06 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321898  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2839  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.58 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.604466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000268  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0225  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.36 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0269  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.36 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0222  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.36 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0986  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.61 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.015482  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0201  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.67 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0168  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.8 
 
 		 153 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5372  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000389201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2486  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.33 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2116  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.86 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0022261  decreased coverage  0.00203199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2082  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.17 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1914  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.59 
 
 		 154 aa  87.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2156  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.57 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.284719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0303  hypothetical protein  36.11 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000014956  unclonable  0.000000628456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1756  hypothetical protein  34.04 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2070  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  33.1 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0237486  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1791  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.99 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2657  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.25 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.941629  normal  0.15794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1215  hypothetical protein  31.21 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3691  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  30.34 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1209  hypothetical protein  30.5 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1758  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.17 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1929  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.85 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3621  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.37 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0933  hypothetical cytosolic protein  27.66 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 456 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.85 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630497  hitchhiker  0.00199357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1237  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.82 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0757  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  31.67 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.447705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0808  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0804  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.299415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  24.68 
 
 		 464 aa  50.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0596  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  27.34 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1509  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.45 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.710297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1821  YbaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  26.19 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  25.9 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5859  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  28.57 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  24.83 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  23.4 
 
 		 154 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1112  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.67 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1523  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  24.18 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  22.31 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.26 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>