More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0332 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0332  putative metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0014  putative metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 
314 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.388397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
868 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
462 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
414 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
357 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
651 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1732  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113874  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 
1073 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 
350 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 
424 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  32.45 
 
 
599 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 
861 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  27.37 
 
 
771 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
398 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 
207 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
389 aa  55.8  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0262  metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 
523 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7866  hypothetical protein  30.37 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.899322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3139  metal-dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 
1335 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
471 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
470 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 
431 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  27.54 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  29.81 
 
 
446 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
438 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 
487 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  25.23 
 
 
619 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 
432 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1780  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
525 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33037  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 
496 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
373 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.78 
 
 
409 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  23.64 
 
 
406 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  27.81 
 
 
326 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
197 aa  52.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
317 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  30.97 
 
 
414 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
220 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
317 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  26.71 
 
 
793 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3977  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.750447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  28.06 
 
 
836 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3863  metal dependent phosphohydrolase  31.36 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4035  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
480 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  28.36 
 
 
525 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
212 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
410 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
833 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
351 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0861  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 
453 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.502442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
652 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  27.07 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1988  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
437 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
654 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2004  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
525 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0562345  hitchhiker  0.000000282251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1971  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
525 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0825869  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  34.02 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  25.53 
 
 
650 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
404 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
498 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  25.22 
 
 
420 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 
345 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  27.39 
 
 
632 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
353 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
718 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4416  metal-dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
368 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.13 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
403 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  30.63 
 
 
1171 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
467 aa  49.3  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
506 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 
446 aa  48.9  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
402 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  31.86 
 
 
550 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  31.11 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  24.06 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4938  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3561  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.878767  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1447  putative metal dependent phosphohydrolases  34.83 
 
 
717 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2105  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
525 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173233  normal  0.407049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  26.73 
 
 
524 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 
545 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0385  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
199 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  26.06 
 
 
649 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>