More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0735 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0735  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.102378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1931  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  65.98 
 
 		 195 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.176665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09301  putative pseudouridylate synthase  60.58 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1933  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  44.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1281  pseudouridine synthase  40.85 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.147193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3106  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  42.86 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.774477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1736  pseudouridine synthase  43.38 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4154  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  43.27 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0821  pseudouridylate synthase  40.48 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0454843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  42.72 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2804  pseudouridylate synthase  40.09 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.257511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4330  pseudouridine synthase  42.4 
 
 		 245 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3988  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0834  pseudouridylate synthase  40.65 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0783  pseudouridylate synthase  41.35 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202814  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1610  pseudouridine synthase  40.85 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911925  normal  0.237577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.38 
 
 		 225 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000100067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1323  pseudouridine synthase  39.91 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  39.51 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3139  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.38 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3875  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.85 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0462638  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0658  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  43.54 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  37.56 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0791  pseudouridine synthase  43.63 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00896147  normal  0.0723816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0799  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  42 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1692  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  41.31 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  41.75 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  41.75 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0738  pseudouridine synthase  40.19 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  37.07 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  37.56 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2706  pseudouridine synthase  37.56 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1592  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  39.72 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3706  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3515  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.18243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0066  pseudouridine synthase  43.54 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.22289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1879  pseudouridine synthase RluA  40.93 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0733  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  38.6 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3583  pseudouridine synthase  40.38 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  38.76 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3048  pseudouridylate synthase  40.85 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  39.13 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0917  pseudouridine synthase  39.25 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0072  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  42.57 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1232  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  39.91 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22000  pseudouridine synthase RluA  40.47 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921344  hitchhiker  0.0000000000442265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2195  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  45.69 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  39.13 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  37.16 
 
 		 329 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.89 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  39.61 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  43.37 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  40.78 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  36.1 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.1 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0515  pseudouridylate synthase  41.58 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35140  Pseudouridylate synthase RluA  39.35 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3831  pseudouridylate synthase  38.76 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1276  pseudouridine synthase  42.38 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.220673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4024  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  42.56 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.94 
 
 		 333 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  38.86 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2087  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  39.18 
 
 		 245 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000349962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  36.07 
 
 		 551 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2148  pseudouridine synthase  41.79 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  37.32 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3067  pseudouridine synthase  42.93 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  35.62 
 
 		 551 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  36.84 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  37.32 
 
 		 223 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3827  pseudouridine synthase  43.08 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  41.98 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0767  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.82 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000401131  normal  0.046253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3568  pseudouridine synthase  40.82 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0161869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  37.8 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  37.14 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2192  pseudouridine synthase  39.81 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5337  pseudouridine synthase  44.62 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.588803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  35.94 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  32.54 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  39.27 
 
 		 339 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2529  pseudouridine synthase  39.34 
 
 		 578 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3630  pseudouridine synthase  42.56 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.146108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0567  pseudouridine synthase  34.11 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2765  pseudouridine synthase  38.99 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.416224  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  36.41 
 
 		 331 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  39.45 
 
 		 316 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  39.55 
 
 		 339 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  36.41 
 
 		 327 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.76 
 
 		 334 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.81 
 
 		 339 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.39 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2989  pseudouridine synthase  38.1 
 
 		 548 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.79 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0607  pseudouridine synthase  40.41 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0536  RNA pseudouridine synthase family protein  35.16 
 
 		 567 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2250  pseudouridine synthase  33.19 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>