113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2334 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1053    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  68.8 
 
 
530 aa  704    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.32 
 
 
507 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  36.76 
 
 
537 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.43 
 
 
499 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
685 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.45 
 
 
655 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.06 
 
 
650 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  35.53 
 
 
359 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 
236 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.19 
 
 
372 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  37.01 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.88 
 
 
322 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.43 
 
 
291 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.2 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2536  hypothetical protein  32.56 
 
 
286 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.72 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.71 
 
 
277 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  34.88 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.8 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.02 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.89 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.96 
 
 
410 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.76 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.81 
 
 
258 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  32.52 
 
 
394 aa  57.4  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.96 
 
 
219 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 
299 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.39 
 
 
205 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.38 
 
 
215 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.9 
 
 
194 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.02 
 
 
247 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.26 
 
 
193 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.83 
 
 
193 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.04 
 
 
201 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  35.05 
 
 
215 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.95 
 
 
205 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
256 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.66 
 
 
361 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  33.08 
 
 
354 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 
299 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 
299 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.68 
 
 
205 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  36.67 
 
 
225 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.46 
 
 
216 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.46 
 
 
252 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.51 
 
 
207 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.74 
 
 
203 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  28.36 
 
 
257 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.42 
 
 
235 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.83 
 
 
221 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 
210 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
207 aa  50.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
204 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
233 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 
216 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  39.47 
 
 
177 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  40.45 
 
 
217 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
190 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.96 
 
 
209 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.04 
 
 
216 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.67 
 
 
199 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 
200 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.46 
 
 
211 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  32.17 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  31.46 
 
 
233 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.05 
 
 
429 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
301 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  29.58 
 
 
367 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  30.15 
 
 
385 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
226 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 
205 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
223 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.18 
 
 
248 aa  47.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.48 
 
 
200 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.46 
 
 
211 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.04 
 
 
203 aa  47.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
226 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.55 
 
 
212 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
226 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
226 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  31 
 
 
248 aa  47  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
231 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
231 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
206 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
287 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
231 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  29.6 
 
 
308 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
202 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.18 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.14 
 
 
223 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.64 
 
 
209 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 
315 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.47 
 
 
319 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.02 
 
 
215 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48 
 
 
194 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  30.21 
 
 
255 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.74 
 
 
229 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.74 
 
 
229 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>