86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4949 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.31 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
316 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  33 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  35.78 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  32.06 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  36.79 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.6 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.35 
 
 
322 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.07 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.78 
 
 
499 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.34 
 
 
410 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.02 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  30.37 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.33 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
530 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.02 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  41.86 
 
 
537 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.43 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.43 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
226 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.76 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  31.91 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.35 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.96 
 
 
396 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  40 
 
 
443 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
655 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
685 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.51 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  39.02 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.56 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
650 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.01 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.9 
 
 
428 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.56 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 
197 aa  46.2  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
402 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.97 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  40.24 
 
 
385 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 
361 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1035  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3- phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.54 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  32.26 
 
 
193 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.29 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  32.39 
 
 
386 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01260  cardiolipin synthase, putative  36.71 
 
 
341 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.02 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.85 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 
397 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.65 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.18 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52642  cardiolipin synthase  32 
 
 
199 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0272698  normal  0.299737 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.78 
 
 
209 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0012  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.16 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.08 
 
 
163 aa  42  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.52 
 
 
211 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.52 
 
 
211 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.19 
 
 
204 aa  42  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.21 
 
 
315 aa  42  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>