67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2439 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.1 
 
 		 316 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.2 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  42.99 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.75 
 
 		 291 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.73 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  40.89 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.95 
 
 		 372 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  40.2 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 		 247 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.58 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 		 530 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  37.01 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.59 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  38.26 
 
 		 537 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  31.16 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.85 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.34 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  35.37 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.78 
 
 		 229 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.82 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 226 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.94 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.69 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.05 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  32.79 
 
 		 198 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.52 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  31.97 
 
 		 198 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  35.14 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.45 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  33.33 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  35.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.32 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.16 
 
 		 219 aa  46.6  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.62 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.91 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.95 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.72 
 
 		 428 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 		 200 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3111  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.04 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.15 
 
 		 193 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.19 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.68 
 
 		 209 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 		 208 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 203 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 		 215 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>