113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1175 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 530 aa  1057    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  68.8 
 
 		 525 aa  703    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.13 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  38.81 
 
 		 537 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.95 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.66 
 
 		 685 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.68 
 
 		 655 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 		 650 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.23 
 
 		 236 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  36.72 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.76 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.15 
 
 		 316 aa  67  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.45 
 
 		 277 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.51 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2536  hypothetical protein  27.82 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204759  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.2 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  34.55 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.85 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 193 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  36.08 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  34.55 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  27.98 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 		 425 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  34.02 
 
 		 255 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.11 
 
 		 205 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 299 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.87 
 
 		 194 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  40.21 
 
 		 205 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.25 
 
 		 218 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.72 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.35 
 
 		 233 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.96 
 
 		 190 aa  52  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.96 
 
 		 210 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.51 
 
 		 202 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.86 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  31.31 
 
 		 215 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.65 
 
 		 215 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  38.46 
 
 		 308 aa  50.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.2 
 
 		 203 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.71 
 
 		 258 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  32.14 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 195 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 221 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 		 211 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.05 
 
 		 205 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.46 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 216 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  35.37 
 
 		 233 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.13 
 
 		 223 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.28 
 
 		 361 aa  47.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.53 
 
 		 200 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.79 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 		 211 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  38.64 
 
 		 217 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 252 aa  47.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.06 
 
 		 318 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.13 
 
 		 220 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 		 207 aa  47  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.63 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  31.62 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 		 210 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 209 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  27.84 
 
 		 257 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.82 
 
 		 203 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  41.98 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.95 
 
 		 229 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.84 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 205 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.57 
 
 		 192 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 212 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 205 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  35.16 
 
 		 225 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  39.56 
 
 		 206 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  28.66 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.23 
 
 		 229 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.23 
 
 		 229 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  28.35 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>