54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3067 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  100 
 
 		 402 aa  794    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  34.97 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.83 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  35.14 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  38.72 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  36.58 
 
 		 385 aa  145  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  36.07 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.71 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.06 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.6 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  28.96 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.52 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.88 
 
 		 193 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 210 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.72 
 
 		 193 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.96 
 
 		 499 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 		 194 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.93 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.69 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.62 
 
 		 210 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.37 
 
 		 192 aa  47  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.14 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.66 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.5 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2890  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0022345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.18 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.95 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  34.82 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  32.39 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 211 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  37.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  32.31 
 
 		 537 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 259 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0529  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.7 
 
 		 258 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  0.417482 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33864  predicted protein  27.86 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0421094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.96 
 
 		 655 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 200 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.38 
 
 		 247 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 259 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 200 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>