71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2359 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  67.2 
 
 		 372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.16 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.41 
 
 		 291 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.12 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  43.07 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  43.3 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  39.56 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.39 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.56 
 
 		 507 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.72 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  35.53 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  31.56 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.66 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.04 
 
 		 685 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.07 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.79 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  29.37 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.04 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.58 
 
 		 226 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  33.72 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.24 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.68 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 197 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  38.24 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  42.68 
 
 		 233 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.05 
 
 		 211 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  39.02 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.27 
 
 		 428 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.14 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.05 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.69 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.16 
 
 		 193 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.51 
 
 		 200 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.83 
 
 		 203 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 212 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  38.55 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  43.24 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.75 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.94 
 
 		 199 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.48 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.74 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.94 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.16 
 
 		 193 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.43 
 
 		 203 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.54 
 
 		 201 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.95 
 
 		 215 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>