78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1803 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.36 
 
 		 226 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  70.91 
 
 		 226 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.04 
 
 		 226 aa  296  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  68.33 
 
 		 226 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  71.98 
 
 		 231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  65.62 
 
 		 233 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  75 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  75 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  75 
 
 		 231 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  68.18 
 
 		 276 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  70.14 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  70.83 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  67.01 
 
 		 203 aa  258  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.26 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.77 
 
 		 410 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.75 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.38 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.93 
 
 		 507 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.33 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 		 396 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  35.37 
 
 		 385 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  37.8 
 
 		 359 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  30.77 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  30.08 
 
 		 354 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  32.67 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 530 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.41 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.38 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1749  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 182 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.73 
 
 		 499 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.52 
 
 		 323 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.29 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  30.97 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.05 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0504  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.43 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.5 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  27.69 
 
 		 394 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 256 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.78 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  28 
 
 		 289 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.47 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 397 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0669  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  34.52 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269578  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2553  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.86 
 
 		 271 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0204712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2776  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  29.75 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0885  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  29.29 
 
 		 537 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.88 
 
 		 252 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0834  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 		 271 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.238829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 685 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 361 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0529  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 258 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  0.417482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.28 
 
 		 211 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.92 
 
 		 228 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 258 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1796  phosphatidylserine synthase  32.26 
 
 		 256 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1729  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.26 
 
 		 256 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1688  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13221  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 271 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>