76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3476 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 228 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.04 
 
 		 229 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.33 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.78 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346062  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3295  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.46 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4986  hypothetical protein  37.21 
 
 		 177 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207268  normal  0.0734509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3226  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.79 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4950  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.18 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000101187  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.09 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.9 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.71 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.76 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.21 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.88 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.14 
 
 		 425 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.04 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.96 
 
 		 428 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.47 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.81 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.93 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.9 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.62 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  31.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.23 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.93 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.79 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.11 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.11 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.11 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.11 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.74 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  30.13 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.19 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.46 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.53 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  30.59 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.95 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  30.59 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.28 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.4 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.63 
 
 		 428 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.5 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1363  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.84 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.98 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.52 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.52 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.03 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.08 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.1 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1608  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00805747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.69 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 		 226 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>