73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4125 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.34 
 
 
226 aa  420  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  90.91 
 
 
226 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  93.94 
 
 
226 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  90.91 
 
 
226 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
231 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.91 
 
 
229 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  84.48 
 
 
276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
229 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
229 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
229 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
229 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  84.48 
 
 
229 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.17 
 
 
221 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  74.76 
 
 
233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  79.27 
 
 
233 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.43 
 
 
203 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
197 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.38 
 
 
410 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
428 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  31.93 
 
 
385 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.45 
 
 
291 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.88 
 
 
256 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.86 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  34.13 
 
 
359 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.14 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  30.57 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  30.33 
 
 
354 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  35.29 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  28.49 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
372 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
507 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.66 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
211 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.48 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  33.61 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
530 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.91 
 
 
396 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.66 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
259 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28 
 
 
397 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
311 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 
318 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.41 
 
 
193 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.95 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.19 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.79 
 
 
499 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.75 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 
429 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0079  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.12 
 
 
169 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.93 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.14 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.09 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  34.74 
 
 
537 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1078  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.36 
 
 
175 aa  42.7  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.2 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
248 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13221  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.1 
 
 
271 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>