83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0624 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.85 
 
 
233 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  73.27 
 
 
226 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.81 
 
 
226 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  71.89 
 
 
231 aa  294  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  75.88 
 
 
203 aa  290  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  76.44 
 
 
231 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  76.44 
 
 
231 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  76.44 
 
 
231 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.35 
 
 
226 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  77.18 
 
 
276 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  73.83 
 
 
226 aa  287  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  77.18 
 
 
229 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  67.42 
 
 
221 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.47 
 
 
197 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.85 
 
 
410 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.62 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.88 
 
 
428 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  31.4 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.54 
 
 
507 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.4 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  42.68 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.47 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.2 
 
 
396 aa  52.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
216 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  33.77 
 
 
289 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  33.9 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  31.4 
 
 
354 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  38.24 
 
 
385 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4074  hypothetical protein  33.61 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  36.79 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.95 
 
 
372 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.6 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 
530 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.25 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.52 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  35.14 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.27 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.85 
 
 
499 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1734  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.86 
 
 
322 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.27 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0392  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.68 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  29.52 
 
 
394 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  33.01 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2341  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.1 
 
 
428 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.26 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0564  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  38.03 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.74 
 
 
397 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.64 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0552  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  38.03 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0669  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.98 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1691  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.02 
 
 
207 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.79248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
311 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.11 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3269  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0970526  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.59 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2320  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.274162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.26 
 
 
425 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0645  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.62 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119591  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.9 
 
 
193 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
211 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 
219 aa  42  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1729  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.69 
 
 
256 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0079  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.27 
 
 
169 aa  42  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2251  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.88 
 
 
185 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
316 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>