59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0888 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
258 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.17 
 
 
312 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
261 aa  198  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.13 
 
 
242 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  44.35 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.02 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.59 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.11 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.82 
 
 
322 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.56 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  41.38 
 
 
289 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
316 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  35.81 
 
 
525 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  41.18 
 
 
537 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.69 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
226 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.99 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
530 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.38 
 
 
655 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  35.16 
 
 
359 aa  49.3  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
203 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.45 
 
 
507 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.67 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.9 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  34.41 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.56 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.49 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  29.2 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.64 
 
 
650 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  40 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
236 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 
204 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.92 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
499 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.9 
 
 
202 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0274  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  37.35 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  30.26 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.78 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.04 
 
 
410 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.53 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.78 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.38 
 
 
372 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8198  predicted protein  33.33 
 
 
119 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.391811 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 
190 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.63 
 
 
205 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2849  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  39.29 
 
 
200 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2893  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  39.29 
 
 
200 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.71 
 
 
311 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2880  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  39.29 
 
 
200 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.912899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>