92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0408 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
372 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  67.2 
 
 
359 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.82 
 
 
322 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.38 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 
291 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  41.54 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  42.34 
 
 
289 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  37.95 
 
 
277 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.96 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.84 
 
 
507 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  32.99 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
530 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.04 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  34.19 
 
 
525 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
655 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  39.08 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.38 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.29 
 
 
247 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.68 
 
 
197 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 
650 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.37 
 
 
210 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.61 
 
 
276 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  60.1  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.61 
 
 
229 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 
685 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.24 
 
 
226 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.27 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
231 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
231 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
318 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
231 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  26.47 
 
 
257 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
226 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
226 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  37 
 
 
212 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.04 
 
 
231 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  36.56 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.25 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.26 
 
 
210 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 
203 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29 
 
 
197 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
197 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.82 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.16 
 
 
216 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 
200 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.63 
 
 
211 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.63 
 
 
211 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.74 
 
 
200 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.58 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29 
 
 
315 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1073  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
221 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2734  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
221 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191627  normal  0.0362866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2860  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46242  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.24 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0979  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.35 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
200 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4511  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  34.21 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143394  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0872  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.62 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.22 
 
 
209 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.23 
 
 
212 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.74 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2517  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  40.91 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
204 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0227  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.02 
 
 
208 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000023759  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.94 
 
 
192 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0749  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.01 
 
 
243 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000801084  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 
194 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3325  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.47 
 
 
270 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.5 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1950  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  38.24 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.42 
 
 
212 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1772  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  38.24 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209764  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
193 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.34 
 
 
193 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1462  CDP-diacylglycerol-phosphatidylglycerol phosphatidyltransferase  35.14 
 
 
202 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.332491  normal  0.0171397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.23 
 
 
260 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1720  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  39.71 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.047283  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 
223 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.46 
 
 
261 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>