50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5671 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
685 aa  1337    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.37 
 
 
655 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.92 
 
 
650 aa  287  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.11 
 
 
507 aa  256  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.97 
 
 
499 aa  250  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  35.61 
 
 
537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.99 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  31.68 
 
 
525 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1353  hypothetical protein  42.07 
 
 
207 aa  94.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4109  hypothetical protein  39.41 
 
 
236 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3868  hypothetical protein  42.14 
 
 
243 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.64 
 
 
236 aa  89.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0721  hypothetical protein  38.01 
 
 
207 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.01403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  32.88 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1174  hypothetical protein  36.63 
 
 
238 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.96 
 
 
291 aa  67  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2535  hypothetical protein  35.37 
 
 
212 aa  67  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.256351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2333  hypothetical protein  41.27 
 
 
235 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.4 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  34.55 
 
 
277 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  39.09 
 
 
323 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.37 
 
 
372 aa  60.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  29.55 
 
 
289 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 
247 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.33 
 
 
314 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
322 aa  50.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 
210 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  36.71 
 
 
198 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  28.06 
 
 
257 aa  48.9  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.67 
 
 
316 aa  48.9  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  36.71 
 
 
198 aa  48.9  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.43 
 
 
193 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
219 aa  48.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  36.84 
 
 
385 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 
221 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.52 
 
 
410 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.56 
 
 
203 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.03 
 
 
216 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
207 aa  47.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.63 
 
 
315 aa  47  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  39.73 
 
 
195 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.73 
 
 
193 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.73 
 
 
195 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.13 
 
 
299 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2536  hypothetical protein  23.42 
 
 
286 aa  45.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  36.71 
 
 
308 aa  45.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  32 
 
 
255 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
212 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>