77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0213 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  52.11 
 
 
233 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.76 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.26 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
226 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
226 aa  175  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.89 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.65 
 
 
231 aa  168  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.49 
 
 
226 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.49 
 
 
226 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 
231 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.35 
 
 
276 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.91 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
410 aa  68.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
396 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  32.61 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.89 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  24.65 
 
 
277 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  34.48 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  29.85 
 
 
289 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.68 
 
 
372 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 
507 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0885  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.21 
 
 
271 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
291 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
299 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
299 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 
190 aa  48.1  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.53 
 
 
216 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.64 
 
 
322 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3506  phosphatidylserine synthase (CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase)  33.87 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  39.29 
 
 
385 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.05 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 
247 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
224 aa  45.1  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0970526  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0564  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.14 
 
 
315 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0552  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.14 
 
 
315 aa  44.7  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.59 
 
 
194 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  35.21 
 
 
308 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  28.93 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62120  phosphatidylserine synthase  32.69 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0144145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  29.46 
 
 
394 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
655 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5407  phosphatidylserine synthase  32.69 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0504635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.7 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  36.36 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.81 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  32.14 
 
 
257 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0645  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
283 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.57 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.13 
 
 
428 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.87 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
259 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.07 
 
 
315 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3641  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
198 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1759  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  30.77 
 
 
244 aa  42  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13221  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
271 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42490  phosphatidylserine synthase  31.2 
 
 
270 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00105824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 
428 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.71 
 
 
218 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1463  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  31.71 
 
 
323 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.69 
 
 
429 aa  41.2  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>