55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2532 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  100 
 
 		 248 aa  484  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  74.6 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  60.32 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  63.14 
 
 		 273 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.11 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.96 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.61 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  30.84 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 655 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.45 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.86 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.86 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.86 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.37 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  33.01 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  28.34 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.94 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.67 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.54 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.78 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.19 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 507 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.56 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.35 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  31.45 
 
 		 525 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.35 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  36.49 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  30.89 
 
 		 537 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  28.97 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 		 650 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.68 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.92 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.88 
 
 		 372 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.49 
 
 		 202 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 203 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.63 
 
 		 216 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 		 211 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 		 397 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>