77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4106 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
273 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  61.24 
 
 
256 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  63.14 
 
 
248 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  55.25 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.7 
 
 
252 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.38 
 
 
530 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 
410 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.63 
 
 
655 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.65 
 
 
507 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  31.19 
 
 
525 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.59 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.64 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  40 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 
650 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.04 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.24 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  26.05 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.23 
 
 
206 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.35 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.35 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  35.24 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.35 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  31.48 
 
 
537 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.05 
 
 
499 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.12 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.29 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.78 
 
 
221 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  27.91 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 
216 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.17 
 
 
236 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  32 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  48 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.98 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.47 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.47 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.31 
 
 
207 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.4 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.32 
 
 
210 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  34.25 
 
 
359 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  25.53 
 
 
289 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.05 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.42 
 
 
685 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  31.9 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.83 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.08 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00913  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase PIS (AFU_orthologue; AFUA_1G15790)  33.33 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.635906  normal  0.333499 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.83 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.58 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.79 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.36 
 
 
397 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.38 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.63 
 
 
203 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.93 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.67 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.46 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.24 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.94 
 
 
205 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
209 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.57 
 
 
218 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 
216 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>