88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2259 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13221  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.25 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
201 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.24 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.82 
 
 
211 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.82 
 
 
211 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
209 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.87 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.35 
 
 
206 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.85 
 
 
256 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.36 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.35 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  30.39 
 
 
193 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.66 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.34 
 
 
190 aa  48.9  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  35.35 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.08 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.73 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.17 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.37 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.3 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.34 
 
 
193 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
287 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.07 
 
 
206 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.07 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.07 
 
 
206 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38 
 
 
203 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.61 
 
 
203 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.04 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00913  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase PIS (AFU_orthologue; AFUA_1G15790)  39.47 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.635906  normal  0.333499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  33.96 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.86 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.59 
 
 
194 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36 
 
 
205 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.07 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.52 
 
 
231 aa  45.4  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  32.97 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  32.97 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.68 
 
 
205 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 
195 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.09 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 
530 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  29.41 
 
 
394 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.08 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.76 
 
 
410 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.3 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.03 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3515  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.76 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.85 
 
 
205 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.81 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.28 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.36 
 
 
361 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  24.77 
 
 
212 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
499 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.28 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
218 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.04 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  32.26 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.12 
 
 
226 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.28 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  42.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.06 
 
 
655 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
202 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
221 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00510  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase, putative  26.92 
 
 
354 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.304224  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
205 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  31.82 
 
 
308 aa  42  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
205 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>