74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2962 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60.27 
 
 		 219 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  61.08 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.13 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.33 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.94 
 
 		 205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.13 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  58.13 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.13 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  58.13 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.13 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  58.13 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  54.19 
 
 		 202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  57.64 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  51.72 
 
 		 208 aa  194  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  50.74 
 
 		 206 aa  191  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.24 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  51.96 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.93 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.78 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.74 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.36 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.61 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.98 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.27 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.16 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.82 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.1 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  44.85 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.98 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  30.23 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  30.23 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.36 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 410 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.1 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.76 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.59 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.76 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0295  CDP-alcohol phosphatidyl transferase  35.21 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  34.16 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.28 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2686  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.25 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0505612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0780  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.8 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.71 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.08 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.82 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.86 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.26 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  28.28 
 
 		 402 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.05 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.4 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0880  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.8 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.993404  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.76 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.93 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.84 
 
 		 428 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1046  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.8 
 
 		 177 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0901  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.39 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.49 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0959  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.39 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1041  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.39 
 
 		 178 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.57 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1129  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0862  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.39 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.49 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>