98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3305 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
247 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.13 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.26 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.17 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.95 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.48 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.55 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.64 
 
 
428 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.08 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.11 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.09 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.71 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.34 
 
 
165 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.74 
 
 
199 aa  58.9  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.51 
 
 
205 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 
190 aa  58.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.69 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.35 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.33 
 
 
192 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.08 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.34 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  33.14 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.69 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.92 
 
 
201 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  29.17 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  31.9 
 
 
177 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.41 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  30.4 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.2 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.09 
 
 
301 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.64 
 
 
530 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.24 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
210 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.04 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.57 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.55 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.85 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  32.48 
 
 
217 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
192 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.6 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.34 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.14 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.42 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.47 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.28 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.97 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
219 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.12 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.2 
 
 
197 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.46 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.62 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.61 
 
 
410 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1759  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  39.47 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3420  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.21 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000051614  hitchhiker  0.0000918483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.96 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  42.5 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.11 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.75 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.17 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  31.54 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.38 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  35.45 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3476  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
507 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.67 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2182  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.73 
 
 
361 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2776  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  56.76 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.891393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3077  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000136505  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.79 
 
 
204 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.72 
 
 
205 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1225  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.21 
 
 
244 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2154  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  41.86 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3085  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  42.47 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
242 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0608  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
242 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
242 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>