61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1296 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
214 aa  420  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.87 
 
 
219 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  53.88 
 
 
206 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  53.23 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  47.85 
 
 
208 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.13 
 
 
221 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.02 
 
 
205 aa  194  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  51.24 
 
 
203 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.04 
 
 
206 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  56.04 
 
 
206 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.04 
 
 
206 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  56.04 
 
 
206 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.56 
 
 
206 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.56 
 
 
206 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.38 
 
 
206 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.07 
 
 
206 aa  187  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  54.59 
 
 
206 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.74 
 
 
205 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.25 
 
 
201 aa  184  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.33 
 
 
205 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.85 
 
 
205 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.85 
 
 
215 aa  141  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.81 
 
 
202 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.94 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.71 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.1 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  43.59 
 
 
202 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.81 
 
 
207 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.1 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.13 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.66 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.73 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  29.59 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.59 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.51 
 
 
195 aa  64.7  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.62 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.64 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.21 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.21 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 
410 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
198 aa  48.9  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.14 
 
 
218 aa  48.9  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
259 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.36 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
194 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.28 
 
 
193 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1367  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.56 
 
 
315 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1115  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.84 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2947  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  32 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2716  hypothetical protein  37.23 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4661  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  38.37 
 
 
275 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.141457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2847  hypothetical protein  37.23 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1744  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  28.49 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
201 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2858  phosphatidylserine synthase-like  28.57 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0880  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.18 
 
 
177 aa  41.2  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.993404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>