67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  780    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.15 
 
 
397 aa  338  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.05 
 
 
396 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  42.7 
 
 
354 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  43.35 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  40.27 
 
 
443 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  37.98 
 
 
367 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  38.72 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.23 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  25.09 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.65 
 
 
212 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.5 
 
 
530 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.39 
 
 
208 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.32 
 
 
507 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.22 
 
 
499 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0504  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  38.81 
 
 
253 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  32.52 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  40.86 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1194  putative integral membrane protein  36.9 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.86 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.84 
 
 
194 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.49 
 
 
193 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.21 
 
 
216 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
299 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.14 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.68 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  37.31 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.25 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  37.31 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.88 
 
 
210 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  30.84 
 
 
233 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.51 
 
 
200 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.66 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.69 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.83 
 
 
226 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  30.61 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 
655 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2499  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  35 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00310356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1132  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.41 
 
 
226 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0392  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
249 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1460  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  38.81 
 
 
255 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89804  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1257  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.85 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.36 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.36 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  31 
 
 
244 aa  44.3  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0608  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
242 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.67 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.77 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.67 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0439  argininosuccinate lyase (arginosuccinase; asal)  33 
 
 
243 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.524804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 
211 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.03 
 
 
202 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
211 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  35.71 
 
 
359 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5407  phosphatidylserine synthase  30.56 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0504635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62120  phosphatidylserine synthase  30.56 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0144145 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.73 
 
 
197 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.47 
 
 
215 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  34.15 
 
 
215 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.72 
 
 
200 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  35.29 
 
 
212 aa  42.7  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 
223 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>