74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3062 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  760    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  54.79 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.35 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  44.35 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  44.51 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  44.95 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.94 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  36.23 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  28.83 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.77 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.77 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.64 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 221 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.53 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.97 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.86 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.61 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  35.37 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.3 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.41 
 
 		 203 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 		 685 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.16 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.44 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.63 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 		 530 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  38.55 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.16 
 
 		 223 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.29 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.26 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.02 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.61 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.1 
 
 		 206 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  32.26 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.93 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.24 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.9 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.35 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1029  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.73 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308197  normal  0.0167262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.82 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5279  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.14 
 
 		 197 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.59 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.91 
 
 		 210 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4739  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 298 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>