73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3539 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  99.56 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.04 
 
 		 226 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.92 
 
 		 226 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.34 
 
 		 231 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.34 
 
 		 231 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.34 
 
 		 231 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  84.21 
 
 		 276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.19 
 
 		 231 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.91 
 
 		 229 aa  351  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.48 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.48 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.48 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.48 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  83.48 
 
 		 229 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.36 
 
 		 221 aa  311  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.3 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  77.72 
 
 		 233 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.29 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.32 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.05 
 
 		 410 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  32.77 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.45 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  30.84 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.43 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.68 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.36 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  37.86 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  31.15 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.93 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  34.65 
 
 		 277 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  30.67 
 
 		 289 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  32.22 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.75 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  31.45 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.41 
 
 		 323 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 507 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 530 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.07 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.06 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.47 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  34.86 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.15 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.71 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.68 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.15 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.43 
 
 		 397 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.84 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  27.36 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.75 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0669  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.06 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0079  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.26 
 
 		 311 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.14 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.79 
 
 		 499 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0722  hypothetical protein  34.88 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0698  hypothetical protein  34.88 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.4 
 
 		 361 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  34.74 
 
 		 537 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1907  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118642  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1078  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.36 
 
 		 175 aa  41.6  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.62 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>