83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1816 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  26.24 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.89 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.78 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  30.47 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.93 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  29.37 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  27.84 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  31.16 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.95 
 
 		 655 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.51 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.27 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.46 
 
 		 314 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.08 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.47 
 
 		 372 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.53 
 
 		 650 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.29 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  36.79 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.56 
 
 		 410 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  31.03 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.56 
 
 		 507 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.95 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.71 
 
 		 361 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.17 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 		 499 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.2 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.99 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.52 
 
 		 685 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.19 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 		 530 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0645  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  42.25 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.95 
 
 		 425 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.23 
 
 		 397 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.31 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0564  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1235  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.4 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4661  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.141457 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0504  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  36 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0552  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  39.44 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  28.36 
 
 		 525 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.94 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.82 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1470  phosphatidylserine synthase  30.53 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  33.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.98 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.23 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2218  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.93 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00278399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3506  phosphatidylserine synthase (CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase)  31.4 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.293518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2439  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.89 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.247509 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  25 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0780  putative CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  37.84 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0295  CDP-alcohol phosphatidyl transferase  37.04 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3373  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0274  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  31.29 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.21 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 191 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  30.83 
 
 		 410 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0557  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.84 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.05 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.81 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3065  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 186 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_004310  BR0444  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.84 
 
 		 278 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.83 
 
 		 428 aa  42  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>