20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4489 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  89.08 
 
 		 238 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.67 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.82 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.73 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.58 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.5 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  33.93 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.28 
 
 		 315 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  29.76 
 
 		 212 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.68 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.82 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.74 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 		 311 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  39.83 
 
 		 386 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3015  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  36.36 
 
 		 232 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 236 aa  42  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>