43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0286 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
316 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  59.69 
 
 
323 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.16 
 
 
322 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.12 
 
 
314 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.3 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  37.57 
 
 
359 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  40.51 
 
 
277 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.99 
 
 
372 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  38.03 
 
 
289 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.3 
 
 
530 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.23 
 
 
507 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
499 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  28.21 
 
 
525 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.98 
 
 
236 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  27.07 
 
 
537 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  30.51 
 
 
257 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.52 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.3 
 
 
655 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.51 
 
 
242 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  31.91 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  32.43 
 
 
198 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.67 
 
 
685 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.67 
 
 
650 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 
218 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.48 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.35 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.58 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.87 
 
 
195 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
233 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.63 
 
 
211 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.63 
 
 
229 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.18 
 
 
226 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>