66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0433 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  89.78 
 
 		 655 aa  999    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 650 aa  1238    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.39 
 
 		 685 aa  312  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.72 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  39.35 
 
 		 537 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.79 
 
 		 507 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  32.33 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 530 aa  183  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1353  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.39 
 
 		 236 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0721  hypothetical protein  34.92 
 
 		 207 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.01403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4109  hypothetical protein  37.5 
 
 		 236 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.3 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1174  hypothetical protein  38.74 
 
 		 238 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.65 
 
 		 291 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  40 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.96 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  31.97 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3868  hypothetical protein  31.98 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.03 
 
 		 372 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.82 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.91 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.07 
 
 		 256 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2535  hypothetical protein  37.16 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.256351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  35.96 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2333  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.66 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.94 
 
 		 247 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  32.53 
 
 		 257 aa  55.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 		 316 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 299 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 299 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 		 216 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.67 
 
 		 361 aa  51.6  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.05 
 
 		 428 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 410 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.82 
 
 		 428 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.92 
 
 		 258 aa  50.8  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.24 
 
 		 204 aa  50.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 210 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.37 
 
 		 261 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.18 
 
 		 203 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 207 aa  49.3  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  26.23 
 
 		 215 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 429 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 216 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.44 
 
 		 223 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.69 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.05 
 
 		 205 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  35.05 
 
 		 354 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 		 194 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  25.24 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.91 
 
 		 273 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.09 
 
 		 202 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  32.93 
 
 		 225 aa  45.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0881  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.71 
 
 		 206 aa  45.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  35.35 
 
 		 367 aa  45.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.81 
 
 		 165 aa  45.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.75 
 
 		 315 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.43 
 
 		 301 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.41 
 
 		 207 aa  44.7  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  27.64 
 
 		 248 aa  44.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  38.04 
 
 		 394 aa  44.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>