129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2920 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
410 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.05 
 
 
226 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.05 
 
 
226 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.91 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.86 
 
 
226 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.3 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.71 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.77 
 
 
221 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  39.58 
 
 
277 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32 
 
 
530 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.83 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.13 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.51 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  28.27 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.51 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34 
 
 
197 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.51 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.51 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.51 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.51 
 
 
229 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.65 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.22 
 
 
507 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  33.96 
 
 
525 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  30.66 
 
 
289 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.55 
 
 
218 aa  60.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.34 
 
 
247 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
211 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  29.46 
 
 
255 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  25.63 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  28.78 
 
 
537 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.71 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38 
 
 
216 aa  56.6  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.26 
 
 
211 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  34.38 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  30.56 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.92 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.26 
 
 
209 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.71 
 
 
216 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.27 
 
 
221 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.79 
 
 
190 aa  53.5  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  28.85 
 
 
248 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.61 
 
 
216 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  30.17 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.44 
 
 
655 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.46 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.17 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  32.58 
 
 
215 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.77 
 
 
218 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
319 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
252 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.5 
 
 
499 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.37 
 
 
210 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.05 
 
 
223 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 
214 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
222 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
222 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
222 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  26.56 
 
 
257 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.07 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
207 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.09 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.08 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.53 
 
 
202 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.66 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3506  phosphatidylserine synthase (CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase)  29.84 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 
235 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.48 
 
 
194 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.25 
 
 
219 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.39 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.43 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.24 
 
 
218 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.8 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  24.62 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  29.2 
 
 
225 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1235  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.69 
 
 
292 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117175  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
210 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.85 
 
 
205 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.35 
 
 
193 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.53 
 
 
291 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.3 
 
 
209 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 
205 aa  46.6  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.89 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.25 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.25 
 
 
215 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34510  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.91 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.013378  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.46 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0834  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.238829  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1537  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3- phosphatidyltransferase  31.58 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  24.04 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>