97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0840 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  38.86 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.16 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.07 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  33.94 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.8 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.91 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.49 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.82 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.39 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.71 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.47 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.78 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.92 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.83 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.92 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.78 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.75 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.65 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.74 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 301 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  33.33 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.91 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.18 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.5 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.52 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.68 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.52 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 218 aa  88.6  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3420  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.89 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000051614  hitchhiker  0.0000918483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.05 
 
 		 425 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.65 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.99 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28 
 
 		 428 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.27 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.95 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.43 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.34 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.33 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.65 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.48 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.09 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.49 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.71 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.61 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.29 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  26.19 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.29 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1225  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.7 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.17 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.05 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.95 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.95 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.05 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.17 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.87 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.47 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.49 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  26.99 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.7 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.64 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.03 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.03 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.66 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.54 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.86 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  31.21 
 
 		 177 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.7 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.64 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.88 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.97 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.15 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.39 
 
 		 410 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.93 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.09 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 		 507 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3077  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.7 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000136505  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.89 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.56 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  28.41 
 
 		 537 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.03 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.52 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 394 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 		 195 aa  42  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.26 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>