67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4519 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.54 
 
 
201 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.54 
 
 
201 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  92.54 
 
 
201 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.54 
 
 
201 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  91.04 
 
 
201 aa  360  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  62.63 
 
 
209 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.04 
 
 
200 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.5 
 
 
203 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50.5 
 
 
205 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.96 
 
 
201 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
197 aa  174  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.68 
 
 
230 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.03 
 
 
211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.03 
 
 
211 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.14 
 
 
201 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50 
 
 
203 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.51 
 
 
205 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.52 
 
 
211 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.04 
 
 
200 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.04 
 
 
200 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.5 
 
 
201 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.5 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  54.61 
 
 
201 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46 
 
 
201 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.59 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.5 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.5 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  44 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  44 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44 
 
 
201 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.9 
 
 
201 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
100 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.55 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
200 aa  61.6  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.51 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.76 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.33 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.31 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  30.13 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.69 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.52 
 
 
204 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.95 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.54 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.89 
 
 
200 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.84 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.54 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  21.76 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.3 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.68 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.3 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.17 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.92 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.55 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.26 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.47 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0840  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.03 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.78 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  31.16 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13221  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.73 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>