87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3006 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  99.49 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  99.49 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.99 
 
 		 201 aa  224  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.44 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.44 
 
 		 201 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  55.44 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  55.44 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.44 
 
 		 201 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.44 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  55.44 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.44 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  54.04 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  54.92 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.87 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.04 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.8 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.26 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.79 
 
 		 230 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.76 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.48 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.8 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.09 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.09 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.45 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.13 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.13 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.5 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.64 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.64 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.64 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.32 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.3 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  50.33 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.78 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  30.38 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.7 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.9 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.33 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.85 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.39 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.95 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.46 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.76 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.83 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.99 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.48 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.87 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.5 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.88 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  31.4 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.3 
 
 		 100 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2327  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.23 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.987779  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  25.26 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  28.12 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.96 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.09 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2954  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.17 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2490  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.66 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.83 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.29 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3460  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.38 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.94 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5163  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.73 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.21 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.91 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1236  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0976506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1749  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.94 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2117  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.31 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.87 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.35 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3851  putative CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  38.71 
 
 		 184 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1289  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 186 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.819659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.01 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.42 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1463  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>