91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4658 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  62.31 
 
 		 205 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  60.41 
 
 		 197 aa  230  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  64.82 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.09 
 
 		 201 aa  219  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.3 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60 
 
 		 211 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  60 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  62.81 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  54.82 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.82 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  54.87 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.79 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.04 
 
 		 228 aa  188  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.76 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.76 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.76 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.26 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.63 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.76 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.61 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.76 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.74 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.8 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.31 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.98 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  51.01 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.8 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.8 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.31 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.31 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  46.31 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  46.31 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.31 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.81 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.45 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.06 
 
 		 100 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.01 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.26 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.38 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  25.27 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.24 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.97 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.72 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.85 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.62 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.85 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.71 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.88 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.9 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.62 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1665  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.35 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1186  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  26.55 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  34.74 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.5 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.21 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.69 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.31 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  30.12 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.69 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2622  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  26.55 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242072  normal  0.0909521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.05 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.1 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3070  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  24.29 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.21 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1749  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.94 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 259 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2699  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  28.49 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.75 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.7 
 
 		 218 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2139  cdp-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferas (phosphatidylglycerophosphate synthase)  27.59 
 
 		 184 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00838588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.09 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.88 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3594  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  34.55 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155365  normal  0.406623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.81 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2485  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  27.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1958  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  26.01 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0992994  normal  0.703928 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.95 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>