74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1580 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.33 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.8 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.7 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  40.39 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.39 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  40.8 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.08 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  42.42 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.88 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.71 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.71 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.58 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.58 
 
 		 211 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.61 
 
 		 209 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.7 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.83 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.29 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.55 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.08 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.51 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  45.39 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.08 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.12 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  42.56 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.06 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  41.62 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  41.62 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  41.62 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.54 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.67 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.23 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.49 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.5 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  28.19 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.38 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.32 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.79 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.17 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  30.86 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.49 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.64 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.84 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.71 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.38 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.51 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.02 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.16 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.5 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.98 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.88 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  21.11 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  36.25 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.21 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.36 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.71 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0753  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.21 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0382306 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04778  aminoalcoholphosphotransferase (AFU_orthologue; AFUA_3G06650)  30.48 
 
 		 412 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547098  normal  0.367098 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.38 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1608  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.58 
 
 		 185 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00805747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.7 
 
 		 223 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_002620  TC0180  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.76 
 
 		 202 aa  42  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.856562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  23.38 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.27 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2052  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.09 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.211548  normal  0.621229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>