86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
230 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  71 
 
 
205 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  78.5 
 
 
201 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  76.38 
 
 
211 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  76.38 
 
 
211 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  64.82 
 
 
200 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  60.2 
 
 
197 aa  228  8e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.59 
 
 
201 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.94 
 
 
209 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.5 
 
 
203 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.65 
 
 
201 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.65 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.65 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.65 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.65 
 
 
201 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  59.8 
 
 
205 aa  187  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.56 
 
 
228 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.28 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.28 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  51.55 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.81 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.5 
 
 
203 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.43 
 
 
211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.97 
 
 
201 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.18 
 
 
201 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.67 
 
 
201 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  52.28 
 
 
201 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.12 
 
 
201 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.18 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.69 
 
 
201 aa  144  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.18 
 
 
201 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  47.18 
 
 
201 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  47.18 
 
 
201 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.18 
 
 
201 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  47.18 
 
 
201 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.37 
 
 
201 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.75 
 
 
100 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.86 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.54 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  34.59 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  31.01 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.48 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.85 
 
 
211 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.19 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.94 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.83 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.66 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.62 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.1 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.81 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.59 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  35.11 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.57 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0423  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.62 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424141  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.47 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.19 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.79 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.85 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.82 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.1 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.5 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.63 
 
 
200 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.12 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.01 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.75 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.79 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.33 
 
 
193 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.2 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.6 
 
 
259 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.19 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.19 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.4 
 
 
259 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.19 
 
 
222 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.81 
 
 
209 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.06 
 
 
191 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0372  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.44 
 
 
186 aa  42  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.57 
 
 
216 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
194 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>