73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1725 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 203 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.5 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  49.26 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.98 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.79 
 
 		 228 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  55.5 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.49 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.52 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.26 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.76 
 
 		 211 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.76 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.5 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.15 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.19 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.46 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.46 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.79 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.7 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.65 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  43.15 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.25 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.65 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  42.64 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  42.64 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  42.64 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  42.64 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.64 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.8 
 
 		 201 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  42.64 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.94 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.52 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.21 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  27.67 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.1 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  28.26 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.48 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.11 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.39 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.04 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.1 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.13 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2373  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.28 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.486813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.71 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.58 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.86 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.73 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  26.06 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.8 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.04 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.53 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.46 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.03 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.05 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.69 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  31.37 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3111  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.62 
 
 		 274 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.41 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.3 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>