86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5536 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.2 
 
 		 211 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.2 
 
 		 211 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71 
 
 		 230 aa  250  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  74.5 
 
 		 201 aa  244  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  62.31 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  59.09 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.72 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.68 
 
 		 203 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.67 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.14 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.23 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.23 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.23 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.23 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.23 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.5 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  49.49 
 
 		 200 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.49 
 
 		 200 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  50 
 
 		 198 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.26 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.79 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.97 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.13 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  46.15 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.13 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  55.92 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.67 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  44.62 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  44.62 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.62 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.62 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  44.1 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  45.64 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.94 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02967  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.65 
 
 		 100 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  32.67 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  32.08 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.77 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  25.13 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.38 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.83 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.54 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.06 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.86 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.47 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.81 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.31 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.59 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 312 aa  48.9  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.65 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.14 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.3 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.05 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1608  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.81 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00805747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.06 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.61 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.85 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.48 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  25.54 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 		 410 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.73 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.05 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.9 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.54 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.09 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.68 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.1 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1342  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.02 
 
 		 200 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 192 aa  42  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.26 
 
 		 197 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  37.08 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>