54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6361 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6361  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase protein  100 
 
 
209 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.368915  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6182  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  85.58 
 
 
209 aa  329  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130047  normal  0.343003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0112  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.47 
 
 
221 aa  174  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1524  hypothetical protein  50.3 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  44.55 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2934  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.59 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.83 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.83 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.83 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.19 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.54 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  22.99 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.03 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.71 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.44 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.26 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.85 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.55 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.28 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.15 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.78 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.91 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.32 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.93 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.61 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.26 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.9 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  32.2 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.23 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  33.33 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.21 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  36.05 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.07 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.54 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.3 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.55 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.51 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.44 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.55 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  27.55 
 
 
222 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.17 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  25.7 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.27 
 
 
499 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3249  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.4 
 
 
229 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64355  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
211 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.43 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
201 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
201 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>