34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4444 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  53.94 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02850  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.2 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  54.17 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  40.83 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000210752  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.26 
 
 		 238 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.5 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.57 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.3 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.52 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.56 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.94 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  24.79 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.9 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.64 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  28.77 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  29 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  34.21 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.61 
 
 		 507 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.44 
 
 		 184 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  36.56 
 
 		 537 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1115  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  30.68 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>