99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0720 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
499 aa  964    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  54.06 
 
 
537 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.93 
 
 
507 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  39.74 
 
 
525 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.2 
 
 
530 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
685 aa  239  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.86 
 
 
655 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.32 
 
 
650 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.58 
 
 
236 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.21 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  32.05 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.16 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0286  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
316 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2439  hypothetical protein  32.26 
 
 
323 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.09 
 
 
219 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  35.14 
 
 
289 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.71 
 
 
194 aa  63.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.37 
 
 
322 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2536  hypothetical protein  30.92 
 
 
286 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
314 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.78 
 
 
247 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.22 
 
 
201 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.57 
 
 
215 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.33 
 
 
193 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.43 
 
 
428 aa  57  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
315 aa  56.6  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.2 
 
 
193 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.74 
 
 
223 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
301 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
203 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.17 
 
 
216 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.22 
 
 
287 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
190 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.08 
 
 
256 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.48 
 
 
200 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.2 
 
 
165 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  38.53 
 
 
385 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  36.73 
 
 
225 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.09 
 
 
216 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
318 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  35.82 
 
 
265 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.58 
 
 
252 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  30.22 
 
 
394 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.5 
 
 
410 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.09 
 
 
220 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  34.96 
 
 
402 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.84 
 
 
299 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
222 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
222 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  29.71 
 
 
217 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
222 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  35.29 
 
 
212 aa  48.5  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  38.71 
 
 
443 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.84 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.68 
 
 
235 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.84 
 
 
299 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.79 
 
 
233 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.97 
 
 
205 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.73 
 
 
221 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  30.56 
 
 
257 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.82 
 
 
201 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
223 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.63 
 
 
204 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.96 
 
 
264 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
396 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
216 aa  47  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.65 
 
 
259 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.59 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.82 
 
 
210 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  32.67 
 
 
215 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.28 
 
 
311 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 
248 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.23 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 
218 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  30.85 
 
 
233 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.3 
 
 
192 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.41 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 
197 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.35 
 
 
207 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.94 
 
 
215 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.6 
 
 
211 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4444  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 
312 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.479767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.35 
 
 
203 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.97 
 
 
195 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.36 
 
 
203 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.69 
 
 
429 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.97 
 
 
191 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  34.44 
 
 
248 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  36.73 
 
 
201 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
258 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.02 
 
 
219 aa  44.3  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.97 
 
 
195 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.67 
 
 
261 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
214 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
200 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 
205 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>