122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0545 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
195 aa  381  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  98.46 
 
 
195 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.24 
 
 
195 aa  147  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  37.88 
 
 
198 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  37.37 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1921  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.22 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.38 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  30.26 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.32 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14950  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.75 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.46 
 
 
235 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.88 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.5 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.32 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.6 
 
 
206 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  26.6 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.6 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.21 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  25.62 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.6 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.6 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  26.6 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.97 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  26.96 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.6 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  27.07 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.59 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.37 
 
 
216 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0066  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.37 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0596395  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2380  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.08 
 
 
206 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.11 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.81 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.87 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  34.86 
 
 
537 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.79 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.21 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.95 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.09 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.67 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.02 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.77 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.63 
 
 
203 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0227  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.61 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000023759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3420  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.38 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000051614  hitchhiker  0.0000918483 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.44 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.42 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  26.67 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  35.82 
 
 
277 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.94 
 
 
205 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.64 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.37 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.71 
 
 
216 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  23.83 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.46 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.97 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.14 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.6 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.21 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.78 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  24.86 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  24.86 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  24.86 
 
 
222 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.36 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
265 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2405  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.44 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.41 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28132  phosphatidylinositol synthase  30.97 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  25 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.85 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  24.05 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  28.42 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.94 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  29.86 
 
 
177 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.32 
 
 
202 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  40.3 
 
 
289 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.41 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.11 
 
 
187 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000060117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.32 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.63 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.33 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.92 
 
 
301 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.91 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  27.53 
 
 
225 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  26.6 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.73 
 
 
685 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.34 
 
 
200 aa  45.1  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  24.62 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.26 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.4 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>